据说，这以后的下半夜，他的心里平静了许多。从那第一道圣旨的颁布和执行的过程中，他第一次亲身体验到了身为皇帝的无尚威严和无边权力。他也开始有了一点信心：靠着上天和祖宗的福佑，靠着天子的地位、手中的权力，他一定要清除朝中的奸党，重振朝纲。
据说，战战兢兢地煞过了第一夜之后，天气晴和明朗，朱由检在心理上也逐渐进入君临天下的状态。内阁大学士等文武重臣在第二天到宫里补上了劝进的一课，已经定下心来的嗣皇帝接连推辞了3次，最后勉强接受。礼部立即为新皇帝拟定了四个年号，是“乾圣”、“兴福”、“咸嘉”和“崇贞”，朱由检自称不敢当苍天之圣，也不敢以中兴自任，而“咸”字中又带着一个“戈”，主刀兵，不吉，因而圈定了最后一个，并且把“贞”字改为“祯”。这或许体现了他对未来的某种憧憬——他统治的年代将是一个吉祥如意、充满幸福的年代。
还是据说，刚刚登上政治舞台的崇祯帝对于怎样施展阴谋权术还一点都不懂，对于权势泼天的魏忠贤只能是小心翼翼地应付，等待着政局的自然变化。而魏忠贤则抱着能在新天子手下继续得宠的一丝幻想，尽量要得到崇祯帝的欢心。两个人都在小心试探，在整整两个月的时间里，大家似乎相安无事。
然后依旧是据说，在最初的日子里，魏忠贤和他在宫中的爪牙们尽量簇拥在新天子身边，不离其左右，表面上是亲近关怀，其实也不乏监视和竭力施加影响的意思。崇祯帝不敢小觑这个庞大的势力集团，也只得作出无可无不可的样子。但新皇帝内心中的倾向，还是有意无意地透露出来了。在这样的透漏里，魏忠贤集团都一步步的退让着，应承着，这样，崇祯的胆子就更加大了。
然后依旧是据说，九月初一日，魏忠贤向新皇帝提出了辞去东厂职务，回家养病的请求。这是宫中旧例，在一位新皇帝即位后，原来担任重要职务的大太监都应提出辞职。但魏忠贤的这个举动显然也是为了摸清崇祯帝对自己的态度的一种尝试，如果皇帝言辞热切地予以挽留，他大概可以暂时地放下心来；如果崇祯帝批准了辞呈，他也还有机会另做安排。但一时还拿不定主意的崇祯帝的反应却正好在两者之间，既没有同意让他就此回家休养，也没有按照先前的惯例那样大大地褒奖他一番，“温旨慰留”。这种不冷不热的态度使得魏忠贤仍然摸不清头脑，只好继续摸索着前进。
但在另一个问题上，崇祯帝的态度就鲜明多了。在拒绝了魏忠贤辞呈的同时，他客客气气地把客氏送出了宫。
接着，某人得到了上面的一点暗示，于是，就有人跳出来为难九千岁了。最先起事的是御史杨维垣，他属于阉党中为魏忠贤出力不少，但得到实惠却不大的一类牢骚派。十月十四日，他上疏专攻魏忠贤的第一号心腹崔呈秀，所论的却都是些无关痛痒的事，如“与前内阁大学士冯铨争权夺利”，以及“在服丧期间仍然督理宫殿建设工程”等等。
崔呈秀是最早投靠魏忠贤的，为人贪漤无耻，却颇为干练，因而最得魏忠贤的信任。是为五狗之首，谁都知道，魏忠贤能够操纵国家大权，主要是靠这个崔呈秀鼎力支持。杨维垣攻击崔呈秀却褒扬魏忠贤，大概又是一种策略，是在向崇祯帝发出的探测气球。但杨维垣对崔呈秀的弹劾毕竟还是标志着阉党内部一场大分化的开始。
在几天里就出现了一股攻击崔呈秀的风潮，参加者包括在阉党中颇有影响的几个人物，几位主事级的小臣用词还十分激烈。到这时候，崔呈秀只能依照惯例自动请求罢免了。
崇祯当然是为难的允许了。
对崔呈秀的处置是崇祯帝同魏忠贤集团斗争中的关键一步，打响了清除阉党的第一枪。