后来董军骑兵渐到，孙坚才起来，徐徐率军入城，对他们说：“我所以不立即起来走避，是怕士兵互相争先，令各人反而不能入城。”
董卓军见孙军整齐，不敢攻打而归还。
后来孙坚改屯梁东，而董卓派徐荣、李蒙四出虏掠，与孙坚在梁县发生遭遇战，孙军大败，孙坚与数十骑突围而走。
因为孙坚喜欢用红色的头巾，被董军认出，便脱下来给了近将祖茂戴上，引开徐荣军骑兵，孙坚则由小路逃出。
祖茂被敌军追得困迫，便下马将头巾放在一条烧过的柱上，自己则隐藏在草堆中。
骑兵看见头巾，以为是孙坚，便将头巾重重围绕，到近看才发现是柱，便离去。
孙军大多兵将被俘，更以残酷手段所杀，如颍川太守李旻就被烹死，其他士卒则以布缠裹，吊起倒立到地，用热油灌杀。
另外，屯兵河内的王匡亦派泰山兵屯河阳津，准备进攻。
董卓便派出疑兵，摆出要由平阴渡河的样子。暗地却派遣精兵从小平北面渡河，绕过王匡军，在后方攻击，在津北大破王军，死者甚多。
韩馥惧怕袁绍危及自己，便一步一步减少对河内、酸枣联军的粮食输送，军粮耗尽后，联军各自回到守地，但各军仍保持盟友关系。
同时，刘岱与桥瑁二人一向交恶，刘岱便杀了桥瑁，以王肱领东郡太守。
而董卓见盟军撤退，便派韩融、阴修、胡母班、吴循、王瑰想与袁绍等人议和。
众人到河内后，王匡告知袁绍，袁绍不答应，要王匡杀死胡母班、王瑰、吴循等。袁术亦杀了阴修，只有因韩融有德名以幸免。
次年，袁绍与韩馥以献帝年幼，而且被董卓控制，相隔关塞，不知献帝是否平安为由，想立刘虞为帝，曹操拒绝参与，而袁术亦反对。
袁绍又得到一个玉印，在座位中举向曹操手肘，暗示已经准备一切，可以立刘虞为帝，但曹操只是大笑，暗地里却对袁绍此举非常不满。
自此开始，诸侯之间的裂痕更加明显。
不过袁绍仍与韩馥等人，于二月推举刘虞为帝。并且派张岐等人，邀请刘虞讨论事宜。
刘虞却怒叱张岐：“现今天下大乱，国君失去政权。我受重恩，但未能清雪国耻。各位据有州郡，应一起合力，尽心为报王室，反而在造反谋反，是互取耻辱呀！”
刘虞坚辞不受，韩馥等又想请刘虞领尚书事，但刘虞仍拒绝，更斩杀使者。袁绍等人无奈，唯有罢手。
同时，在二月孙坚收复散兵，屯兵阳人。董卓便派胡轸为大督护、吕布为骑督及其他多位都督，率五千步骑攻击孙坚。
大都护胡珍不得军心，当他立下计策，准备偷袭孙坚的时候，却被吕布以及他的帐下将官破坏了计划。
使得孙坚惊醒，胡珍攻城不利。退兵的时候，孙坚出城追击，大败董卓军，斩杀都督华雄等人。
袁术见孙坚大败董卓军，有人便向袁术进言：“假如孙坚得到洛阳，便无法制衡他，这是除去狼而反招来虎呀。”
袁术心疑，便不运军粮给孙坚。孙坚便连夜赶回鲁阳，严辞切责袁术，袁术惭愧，立即调发军粮，孙坚亦回到阳人。
董卓听闻孙坚如此厉害，便派李傕游说孙坚和亲。更称可以令其子弟们担任刺史、郡守，但孙坚大骂董卓，一口拒绝，并且立即进军大谷。
董卓亲自率兵，与孙坚在先帝陵墓间发生战斗。董卓败走，移屯渑池，另在陕集兵。
孙军便进入洛阳宣阳城门，击退吕布。
而后孙坚扫除宗庙，祭祀天地，分兵出函谷关，到新安、渑池防御董卓军。
董卓对长史刘艾说，关东军就只有孙坚才是值得注意，要各路人马留意。
便留董越屯兵渑池，段煨屯兵华阴，牛辅屯兵安邑，其他将领留守各县，对制衡山东，自己则出发向长安。
而孙坚修塞各陵后，便率军还鲁阳。
洛阳因破坏严重，只成为董卓与关东军对抗的屯兵地方而已。
虽然孙坚攻进了洛阳，但联军中的各群雄在这战役中大多都结下仇怨，由一起对抗董卓，转为开拓自己的领土。
讨伐董卓，在没有得到大的成果下，便宣告结束。
而后，袁绍首先用计夺取了韩馥的冀州，并且与与公孙瓒开战，争夺幽州。
而袁术拥有南阳，与新任的荆州刺史刘表交恶。其麾下在讨伐董卓中威名远扬的孙坚，攻打刘表时中伏战死。
袁术因为听闻袁绍得了冀州，就向袁术索要马匹。被袁绍拒绝以后，两兄弟开始决裂。
诸侯割据中原的局面，也开始形成。